環(huán)境微生物中的定量PCR

簡(jiǎn) :

環(huán)境(如土壤、糞便及水環(huán)境等)微生物種屬多樣性以及功能基因差異是目前農學(xué)和醫學(xué)研究的熱點(diǎn)之一。通過(guò)16s rRNA可變區的高通量測序,一定程度上對環(huán)境中的微生物進(jìn)行了屬的鑒定。但對環(huán)境中的功能基因無(wú)法進(jìn)行鑒定分析,目前還只能靠定量PCR方法進(jìn)行檢測。

基本流程

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技術(shù)優(yōu)勢

(1)?????? 本公司擁有多種微生物(如:總細菌、芽孢桿菌、氨氧化細菌等)檢測的質(zhì)粒標準品,而且這些標準品擴增效率高,特異性強,方便的用于后續的細菌種屬的qPCR絕對定量分析。

(2)?????? 本公司構建了多種微生物的功能基因(如:nirS、nirK以及nosZ等)質(zhì)粒標準品,這些標準品擴增效率高,標準曲線(xiàn)相關(guān)系數(R2)均在0.98以上。

客戶(hù)須知:

環(huán)境微生物中的定量PCR

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周期

最終提供客戶(hù)資料

環(huán)境微生物中的定量PCR

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20-30個(gè)工作日(視樣品和基因數目而定

詳細實(shí)驗總結報告(包括基因組DNA提取、質(zhì)粒標準品制備過(guò)程及測序、標準品和未知樣品擴增曲線(xiàn)、標準曲線(xiàn)、熔點(diǎn)曲線(xiàn)、相對表達分析結果,統計分析等)

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案例:

本實(shí)驗對土壤中反硝化細菌中的關(guān)鍵功能基因亞硝酸鹽還原酶(nirK,nirS)和一氧化氮還原酶(nosZ)基因進(jìn)行絕對定量分析,從而探討了氮相關(guān)功能微生物群落豐度與環(huán)境因子的關(guān)系。本實(shí)驗中的質(zhì)粒標準品全部來(lái)自于本公司構建并測序,特異性和靈敏度較高。

?? 不同土壤樣品中nirS、nirKnosZ基因擴增的標準曲線(xiàn)和擴增曲線(xiàn)

客戶(hù)提供:

樣品類(lèi)型

土壤和糞便樣本

水環(huán)境樣本

樣品需要量

500 mg

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5ml

取樣和保存環(huán)境

無(wú)菌管收集,最好保存在-20℃或-80

無(wú)菌管收集、離心,最好保存在-20℃或-80

運輸

杭州市內干冰上門(mén)取樣;

外地客戶(hù)干冰快遞運輸;

組織保存液,冰袋運輸

杭州市內干冰上門(mén)取樣;

外地客戶(hù)干冰快遞運輸;

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*(經(jīng)本公司評估后,實(shí)驗沒(méi)有結果,不收取任何費用)

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